绿环缘蝽(昆虫纲,半翅目,缘蝽科)线粒体基因组分析(英文)

摘要

本研究测定了昆虫纲半翅目姬缘蝽科Rhopalidae绿环缘蝽Stictopleurus subviridis Hsiao的完整线粒体基因组,为异翅亚目蝽次目Pentatomomorpha中的首例研究。该线粒体基因组为全长15139bp的双链环状DNA分子,含有后生动物线粒体基因组中典型的37个基因,AT含量为75.7%。各基因的排列方式与六足动物假想祖先相同。该线粒体基因组结构紧凑,有基因重叠现象。在tRNA-Ile与tRNA-Gln间发现一个罕见的79bp的非编码序列。tRNA-Ser的二级结构中DHU臂缺失,无法折叠成典型的三叶草结构。CO2和CO3终止密码子为T,其下游为同链编码的tRNA基因。基因组AT含量为75.7%,密码子使用频率也反映出AT偏好。两条链上蛋白质编码基因的CG-skew趋势相反,密码子使用频率也反映出两链不同的CG偏好。蛋白编码序列并不总是使用与tRNA的反密码子相对应的密码子,密码子的使用并不随机。使用频率最高密码子为NNA,使用频率最低的密码子为NNG。与臭虫次目Cimicomomorpha中的锥猎蝽Triatoma dimidiata线粒体基因组比较分析表明,ATP8为进化最快的蛋白质,CO1最慢,但tRNA和rRNA基因的进化速率比蛋白质基因低。