2015—2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒分子流行病学特征分析

摘要

目的分析2015—2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒的分子流行病学特征。方法收集2015年1月1日—2018年12月31日期间北京市东城区流感样病例的咽拭子样本,RT-PCR法检测核酸,阳性样本接种至MDCK细胞进行病毒分离,血凝抑制试验鉴定流感亚型。选取30株甲型H1N1pdm09亚型分离株,RT-PCR法扩增血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因序列,并测序。应用DNASTAR 5.0软件将HA、NA序列进行拼接,MEGA 6.0软件建立系统进化树,并进行遗传特征分析。结果共检测样本7533份,甲型H1N1pdm09亚型231份,阳性率为23.24%。30株甲型H1N1pdm09亚型分离株与WHO推荐的北半球疫苗株A-Brisbane-02-2018的HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.42%~99.53%和97.40%~99.32%;NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.11%~99.74%和97.72%~99.80%。HA基因共有16个氨基酸位点发生改变,NA基因共有10个位点发生改变;抗原受体结合位点、糖基化位点和耐药位点均未发生改变。结论2015—2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒HA和NA基因位点发生了一些变异,但抗原性和耐药性未发生改变,与疫苗株匹配性较高。本研究为北京市东城区评价疫苗保护效果及制定流感防治措施提供了实验依据。