桃PpLAC基因家族的鉴定与分析

摘要

为了对桃PpLAC基因家族的功能进行深入研究,本研究利用生物信息学方法对桃PpLAC基因家族进行鉴定,并对其家族成员的理化性质,基因结构,保守基序,染色体定位等进行分析。结果表明,在桃中共鉴定到54个PpLAC基因家族成员,编码氨基酸在367~1559,分子量大小在40.26~175.15 kD,不稳定系数为27.92~42.56,等电点为4.95~9.85,脂肪族氨基酸指数为75.59~93.87,亲水性为-0.373~-0.027,表明Pp LAC基因家族成员均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果表明60%以上的PpLAC蛋白定位在细胞外。Pp LAC基因不均匀的分布在8条染色体上。系统进化树分析将PpLAC基因家族分成6组(G1~G6),并预测不同组成员与木质素及细胞壁合成(G2组)、生物胁迫及植物开花时间(G3组)和响应ABA信号(G5组)可能存在着重要的关系,这一结果为更好的研究桃PpLAC基因功能提供了理论依据。