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苋菜生长素响应因子AtrARF7的克隆及表达

         

摘要

为了解苋菜生长素响应因子(ARF)的表达特性及功能,采用RT-PCR方法从全红苋菜(Amaranthus tricolor L.)中克隆获得1个生长素响应因子AtrARF7基因(GenBank登录号:MW036654)并进行生物信息学分析,同时利用qRT-PCR分析AtrARF7在不同浓度生长素处理下的苋菜幼苗及苋菜愈伤组织中的表达模式.结果表明:苋菜AtrARF7基因含有一个3324 bp的开放阅读框(ORF),编码1107个氨基酸,预测分子量为12.34×10^(3),等电点为6.07,是亲水不稳定蛋白.AtrARF7包括B3、Auxin-resp和AUX_IAA这3个ARF基因特有的结构域;多序列比对和系统进化树分析发现,苋菜AtrARF7蛋白与其他植物ARF7蛋白具有高度一致性,且与甜菜BvARF7蛋白亲缘关系最近.荧光定量结果表明,AtrARF7在不同浓度NAA处理下的苋菜幼苗中呈上调表达;在MS+6.0 mg/L 6-BA+0.5 mg/L 2,4-D培养基中诱导的苋菜愈伤组织处于诱导期时,AtrARF7的表达量达到最高;在添加了不同浓度NAA的继代培养基(MS+6.0 mg/L 6-BA+0.5 mg/L 2,4-D)中AtrARF7均受到调控.本研究表明AtrARF7可能具有ARF家族正调控因子表达特征,其转录水平受到生长素的诱导,且AtrARF7在苋菜愈伤组织形成的3个时期中均有响应,初步推测其参与生长素信号传导途径调控苋菜愈伤组织形成的过程.(图10表2参29)

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