菜心Dof基因克隆、生物信息学分析及表达分析

摘要

Dof （DNA binding with one finger）是植物特有的转录因子，在调控植物生长发育和代谢过程中发挥着重要作用。为明确Dof具体的生物学功能，本研究以‘油绿501’菜心为材料，采用同源克隆法获得了Dof全长序列，并对其编码蛋白结构、基因表达模式及其互作蛋白的调控网络进行分析。结果表明：菜心BcDof3;1基因全长624 bp，编码207个氨基酸，其N-端含有保守的Dof锌指结构。系统进化树分析表明，BcDof3;1与白菜BrDof3;1和拟南芥AtDof2的同源关系较近。RT-qPCR结果表明，BcDof3;1在菜心根、茎、叶、花和种子中均有表达，尤其在叶和花中的表达水平最高；其表达水平受氮调控。互作蛋白网络分析表明，BcDof3;1可能通过中性转化酶、淀粉酶、酰胺酶等调控碳氮代谢。研究结果为深入研究Dof在菜心生长发育和碳氮代谢中提供了理论参考。