长链非编码RNA XLOC008370在食管鳞状细胞癌中的表达和甲基化状态及其与临床病理特征的关系

摘要

目的:检测食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）中长链非编码RNA XLOC008370（long non-colding RNA XLOC008370,lnc RNA XLOC008370）的表达及其甲基化状态,探讨XLOC008370在ESCC发生及发展中的作用机制。方法:分别应用RT-PCR以及甲基化特异性PCR（methylation specific PCR,MSP）法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza-2’-deoxycitydine,5-Aza-d C）处理前后的ESCC细胞系（TE1、TE13、Eca109、T.TN、YES-2）以及ESCC组织及相应癌旁正常组织中XLOC008370的表达和甲基化状态,分析其与临床病理特征的关系。结果:5种ESCC细胞中XLOC008370的表达均呈阴性或弱阳性,经5-Aza-d C处理后,5种细胞中XLOC008370的表达均升高。5种细胞中XLOC008370基因呈高甲基化状态,应用5-Aza-d C处理后,Eca109、Yes-2细胞中XLOC008370基因甲基化程度降低,非甲基化程度增加,其余3种细胞中XLOC008370基因均表现为非甲基化状态。XLOC008370在ESCC组织中的表达显著低于癌旁正常组织（P＜0.05）,并与TNM分期和组织学分化程度密切相关（P＜0.05）。ESCC组织中XLOC008370的启动子区甲基化率为（54.02%,47/87）,显著高于癌旁正常组织（9.20%,8/87）（P＜0.05）,并与TNM分期和组织学分化程度密切相关（P＜0.05）。发生XLOC008370甲基化的ESCC组织中XLOC008370的表达显著低于未发生甲基化的ESCC组织（P＜0.05）。结论:XLOC008370的异常低表达可能与ESCC的发生密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一。