掌叶覆盆子染色体计数及基因组大小测定

摘要

掌叶覆盆子（Rubus chingii Hu）是重要的药用植物，由于基因组数据缺乏，导致其分子生物学研究进展相对缓慢。本研究采用根尖染色体制片技术来确定其倍性；利用流式细胞术和K-mer分析方法对其基因组大小进行了测定。结果如下，掌叶覆盆子根尖染色体数目为2n=2x=14；采用流式细胞术，以萝卜‘Saxa’为内标测定的掌叶覆盆子基因组大小为（255.39±7.58） Mb;K-mer分析估测的掌叶覆盆子基因组大小为262.2 Mb，杂合率为0.91%，重复序列比例为42.54%；根据各分析指标，推测该掌叶覆盆子基因组为一般复杂基因组。本研究结果将为掌叶覆盆子的全基因组测序研究提供重要参考。