大豆耐涝bZIP转录因子Glyma06g08390的生物信息学分析

摘要

bZIP转录因子在响应不同非生物胁迫中起着重要作用。本研究以耐涝性强大豆品种‘齐黄34’作为材料，对其进行没顶淹水处理，取样进行转录组测序，筛选出1个差异表达的bZIP转录因子Glyma06g08390，并对其进行RT-qPCR检测，结果与转录组测序数据趋势一致，呈现上调表达。分析Glyma06g08390蛋白的保守结构域，发现该蛋白内部含有bZIP保守结构域。蛋白三级结构中存在与寡聚化作用的亮氨酸拉链区。预测与Glyma06g08390蛋白互作的蛋白，结果发现有两个蛋白是MAPK信号通路中的蛋白，分别MAPK2和MAPKK2。因此，我们推测Glyma06g08390可能与MAPK2和MAPKK2发生互作，激发了MAPK信号通路来响应涝害胁迫。