罗布麻MYB转录因子家族生物信息学分析

摘要

MYB （v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog）是近年来发现的参与调控植物生长发育、生理代谢和响应逆境等的一类重要转录因子。为了探究MYB转录因子家族在罗布麻中的功能，本研究基于罗布麻第二代和第三代转录组测序数据，共查找到57条MYB基因，其氨基酸数目介于88～1 088，分子量大小介于10.45～121.49 kD，保守结构域分为1R-MYB和R2/R3-MYB两个亚类；经理化性质分析发现，罗布麻MYB转录因子家族蛋白均为亲水性蛋白，并具有较高的热稳定性；由保守基序分析发现，不同MYB转录因子包含的保守基序的数目不同，数目介于1～5；经高级结构预测发现，MYB转录因子家族蛋白以α-螺旋和无规则卷曲结构为主；由系统进化树发现，罗布麻MYB序列在进化上可分为18个小类，根据与罗布麻具有很高的同源性的拟南芥R2/R3-MYB亚族的功能，可以预测罗布麻MYB基因的功能。