基于CTD数据库的双酚A及其衍生物双酚F和双酚S的生物信息学分析

摘要

目的 利用生物信息学技术分析双酚A（bisphenol A, BPA）及其衍生物双酚F（bisphenol F, BPF）、双酚S（bisphenol S, BPS）共同影响的关键信号通路及可能的机制，为BPA及其衍生物BPF、BPS相关研究提供一定的线索和思路。方法 利用比较毒理基因组学数据库（CTD）,筛选BPA及其衍生物BPF、BPS共同影响的hub基因，使用可视化和Hipolt在线工具对hub基因进行通路分析，筛选关键基因。结果 获得BPA及其衍生物BPF、BPS共同影响的50个hub基因，其中EGFR基因Degree最高为22。GO和KEGG富集分析，得到具有统计学意义的差异GO条目140个（P＜0.05）,分别为生物学途径（biological processes, BP）有119个，细胞组分（cellular components, CC）有5个，分子功能（molecular function, MF）有16个，其中BP间有较多交互基因，如EGFR、ESR1和CAV1等。KEGG分析中具有统计学意义差异最高的2条通路，包括膀胱癌(P=3.40×10-6)和甲状腺癌(P=5.21×10-5),并且膀胱癌信号通路主要受到EGFR和CDK4等基因的调控。结论 本次基于2021年4月更新的CTD数据库所开展的生物信息学分析提示，BPA及其衍生物BPF、BPS共同暴露可能引起关键基因EGFR改变，EGFR可能通过成纤维细胞增殖影响膀胱癌的发生发展。