细粒棘球绦虫新疆株胆汁酸钠协同转运蛋白基因的克隆及序列分析

摘要

从新疆株细粒棘球绦虫(Echinococcus granulosus,Eg)原头蚴中克隆胆汁酸钠协同转运蛋白(sodium-bile acid cotransporter,Eg SBACT)基因,进行序列测定和生物信息学分析。首先设计Eg SBACT基因特异性引物,用RT及PCR方法从新疆株细粒棘球绦虫原头蚴提取总RNA,将其反转录成c DNA后扩增Eg SBACT基因并将其克隆至原核表达载体p ET30a中,测序鉴定序列并进行生物信息学分析。结果显示,RT-PCR扩增出一长度约650 bp的基因,测序显示其长度为654 bp,序列与Genbank公布的EUB59978.1完全一致,其编码217个氨基酸,预测其等电点为9.28。同源性分析发现,Eg SBACT蛋白序列与中华枝睾吸虫SBACT(Gen Bank:GAA57409.1)同源性最高,达到43%。进化树分析表明,细粒棘球绦虫的SBACT蛋白与吸虫纲的SBACT相聚集,在进化树上处于一枝,而与其他物种亲缘性较远。由此表明,本研究成功克隆出细粒棘球绦虫Eg SBACT基因。