高通量测序技术筛选早发型重度子痫前期合并胎儿生长受限的胎盘差异微小RNA表达谱及信号通路

摘要

目的探索早发型重度子痫前期(sPE)合并胎儿生长受限(FGR)胎盘组织的微小RNA(miRNA)差异表达谱及相关信号通路。方法收集早发型sPE合并FGR(n=5)和正常孕妇(n=5)的胎盘组织。采用高通量测序技术筛选胎盘中差异表达的miRNA并进行聚类分析。采用TargetScan和miRDB两个靶基因数据库,对差异的miRNA进行靶基因预测。选取两个数据库交叉的靶基因进行GO和KEGG Pathway富集分析,预测靶基因参与的生物学过程及信号通路。结果与对照组相比,sPE组共筛选出35个显著差异表达的miRNA,其中有19个上调,16个下调。还筛选出4个miRNA簇,包括19q13.42、14q32.31、1p36.33和17p13.1。Gene Ontology富集分析表明,差异miRNA与解剖结构、器官系统发育、RNA转录调控、生物合成和代谢过程有关。KEGG Pathway富集分析显示靶基因可能参与Wnt、Hippo、mTOR、Hedgehog等信号通路。富集评分最高的是Wnt信号通路参与调控胎盘发育、维持滋养细胞谱系稳定。6个目标miRNA上下调的趋势和测序结论基本一致且差异倍数相近(P<0.05)。结论早发型sPE合并FGR的胎盘差异性表达的miRNA主要参与胎盘形成及系统器官发育的信号通路。