白桦(Betula platyphylla×B.pendula)BpEIL1基因克隆及生物信息学分析

摘要

EIN3/EILs是乙烯信号转导过程中的重要转录因子,在植物抗逆及不同激素协同和拮抗反应中具有重要作用。本研究通过RT-PCR方法扩增得到白桦BpEIL1基因序列,并利用生物信息学方法对获得的序列进行结构及功能预测。结果表明,白桦BpEIL1基因全长为2968 bp,CDS为1776 bp,编码的蛋白由591个氨基酸构成,属于EIN3超家族成员,是一个亲水性的不稳定蛋白。在白桦基因组中共找到2个EIN3超家族基因,与模式植物拟南芥和毛果杨EIN3超家族基因序列进行比较分析。结果表明,白桦BpEIL1基因与拟南芥AtEIL3和毛果杨PtEIL3基因亲缘关系较近,而另一个基因则与毛果杨PtEIN3基因亲缘关系较近。本研究对白桦BpEIL1基因产物的特征进行了初步的分析,为该基因功能的进一步研究提供了参考。