乙胺丁醇耐药基因embB突变的杂交荧光显微观测

摘要

目的针对耐乙胺丁醇(EMB)的结核分枝杆菌embB303密码子位点,设计扩增引物及特异性发夹DNA探针其相应的单侧延长臂发夹DNA探针,建立发夹DNA探针芯片技术,并运用荧光显微镜观测发夹DNA探针与扩增产物的杂交荧光信号。方法运用Beacon designer软件,设计embB基因包含303密码子的发夹DNA探针,荧光显微镜检测embB303密码子扩增片段与发夹DNA探针杂交后荧光信号,扩增产物测序结果作比较。结果通过荧光显微镜观测到结核标准株及embB303密码子突变株PCR产物与探针杂交后荧光信号存在显著差异;33株耐EMB组与10株H37RV标准株对照组荧光信号强度比较,耐EMB组embB303密码子突变检出率为7%,测序法突变检出率为6%。结论应用荧光显微镜可以高灵敏观测发夹DNA探针与靶序列的杂交荧光信号,从而有效检测单碱基突变;embB303密码子点突变不是结核分枝杆菌耐EMB的主要原因。