基于SNP分子标记的粗叶榕遗传多样性分析

摘要

为揭示粗叶榕种质资源的遗传多样性,本研究利用ddRAD-seq测序技术对131份粗叶榕资源进行测序,分析其遗传结构和遗传多样性。结果表明,在131份粗叶榕资源中共获得1 447 027个SNP。系统进化、遗传结构和主成分分析结果基本一致,131份资源分为3大类,Group 1的核苷酸多态性(π)、观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)最高,分别为0.281 0、0.233 8和0.279 5,表明其遗传多样性最丰富。Group 1和Group 3间的遗传分化程度最高(Fst=0.328 4),Group 1和Group 2间的遗传分化程度最低(Fst=0.231 7)。粗叶榕种质资源的遗传多样性丰富,3个类群间存在明显的遗传分化。本研究可为粗叶榕种质资源的保护和育种研究提供遗传依据。