应用基因芯片技术研究冠心病秽浊痰阻证差异表达基因及其通路

摘要

目的探索冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)秽浊痰阻证患者差异表达基因及相关信号通路,从分子水平阐明CHD秽浊痰阻证的生物学特点。方法纳入2015年2月—2016年3月就诊于新疆医科大学附属中医医院明确诊断为CHD的患者24例,其中秽浊痰阻证组12例、非秽浊痰阻证组12例,另纳入经冠脉造影术排除CHD的12例受试者为对照组。采集外周血并提取总的RNA,通过Human GenomeU133Plus2.0芯片检测获取基因,使用R语言limma软件包筛选差异表达基因,利用STRING构建差异基因编码蛋白互作网络(PPIs),应用Cytoscape插件识别差异表达基因的核心模块,应用Clusterprofiler软件包对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析。结果与对照组比较,CHD患者共筛选出184个差异表达基因,其中165个差异基因表达上调,19个差异基因表达下调。CHD秽浊痰阻证组与非秽浊痰阻证组差异表达基因42个,其中34个差异基因表达上调,8个差异基因表达显著下调,GO和KEGG富集分析中,7个模块显著富集了固有免疫调节、固有免疫正向调节、固有免疫的激活和Fc受体信号通路,模块基因参与了MAPK、NF-κB、PI3K/Akt等信号通路、Ⅰ型糖尿病相关通路、C-型凝集素受体信号通路、剪切应力与动脉粥样硬化相关通路等与CHD有密切关联的信号通路。结论 CHD秽浊痰阻证与冠心病非秽浊痰阻证患者存在显著的差异表达基因,这些差异表达基因显著富集在与冠心病相关的多条功能通路中。