鹅圆环病毒福建株全基因组的克隆及序列分析

摘要

为明确鹅圆环病毒（Go CV）福建株的基因组特点,设计反向引物,从一例生长不良鹅中PCR扩增获取Go CV福建株基因组序列。结果表明,Go CV福建株（命名为FJ2016株）基因组全长为1 821 bp,其编码的复制相关蛋白长度为882 bp,编码293个氨基酸;其编码的抗原相关蛋白长度为753 bp,编码250个氨基酸。从遗传进化关系可见,Go CV在遗传进化上可以分为2个大的分支（Go CV-1与Go CV-2）,FJ2016株处于Go CV-1分支。从核苷酸同源性比较可见,FJ2016株和yk2株核苷酸同源性最高,达98.2%;但与2GK株核苷酸同源性仅为82.4%;与疣鼻天鹅源圆环病毒Sw株（EU056310）核苷酸同源性为73.7%,低于80%。FJ2016株和Go CV-1分支代表株核苷酸同源性在97.3%-98.2%之间,与Go CV-2分支代表株核苷酸同源性在93.1%-93.5%之间。该病例为福建地区首次报道存在鹅圆环病毒感染。