2022年5—9月新疆、江苏口岸输入性新冠病毒基因型分析

摘要

目的对新疆、江苏口岸输入性新冠病毒(SARS-CoV-2)核酸阳性灭活样本开展全基因组测序,掌握输入性SARS-CoV-2基因型及分子特征,为口岸新冠肺炎疫情防控提供理论指导。方法采用商品化荧光定量RT-PCR试剂盒检测2020年5—9月新疆、江苏口岸入境人员咽拭子样本的SARS-CoV-2核酸,检测荧光阈值小于等于32(Ct≤32)的阳性样本用华大二代测序仪进行全基因组测序。结果2020年5—9月,共检测了新疆、江苏口岸入境人员29917份咽拭子样本,检出输入性新冠病毒阳性人员156例,其中江苏口岸113例,新疆口岸43例。对其中41份阳性样本开展了全基因组测序,均为奥密克戎(Omicron)变异株,共15个基因型,最多的是BA.5.2变异株,有17株;其次是BA.2.75变异株,4株;此外还有BA.2、BA.5.1、BA.4等基因型。结论及时掌握了新疆、江苏口岸输入性SARS-CoV-2变异特征,为口岸新冠肺炎防控提供了技术支持。