海岛棉EST-SSR引物的开发与应用研究

摘要

现有的棉花EST-SSR引物大都开发于中棉和陆地棉,尚没有海岛棉EST-SSR开发研究的报道.本研究从实验室构建的海岛棉纤维发育的cDNA文库中先取98条EST序列设计了119对EST-SSR引物.在这些SSR中,三核苷酸重复基序AAG含量最为丰富,达11.76%.用36份材料(13份A基因组二倍体材料,11份D基因组二倍体材料和12份AD基因组异源四倍体材料)评价新EST-SSR引物,119对引物中有76对成功扩增,共产生313条多态性条带,平均每对引物产生4.11条.这些引物的多态性信息含量(PIC)变化在0.17～0.95之间,平均0.53.根据Jaccard’s遗传相似系数对所用36份材料进行了聚类分析,聚类结果为3大类,分别为A基因组材料、D基因组材料和AD基因组材料.此外,有21对引物在本实验室的种间回交群体((鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22)DNA中表现多态性扩增,产生24个多态性位点,其中22个被锚定于该遗传连锁图的12条染色体.本研究不仅详细地概括了这批新的EST-SSR引物的特征,而且有力地证明了其在遗传多样性分析及遗传连锁图构建方面的应用价值.