Alport综合征iPSCs差异性表达新小核糖核苷酸的分析

摘要

目的构建Alport综合征(AS)与正常对照者(NC)诱导多能干细胞(i PSCs)新核糖核苷酸(novel microRNA)差异性表达谱,分析其靶基因功能。方法采用前期工作成功从尿肾状杆细胞诱导成的i PSCs,运用高通量测序平台获得AS与NC的差异性表达谱,使用靶基因预测软件Target Scan进行靶基因预测,靶基因与参考基因比较后,在候选靶基因找到显著富集的GO条目及KEGG通路。结果在AS与NC中发现49个有意义的差异性表达novel microRNAs,其中33个表达上调,16个表达下调。在GO靶基因富集分析中,靶基因主要富集于生物调节、生物新陈代谢、细胞组成、细胞信号传导、酶催化反应、分子转运等过程。在KEGG通路分析中,靶基因主要参与代谢通路、嘌呤代谢、癌症转录调节等过程。结论来源于AS与NC的i PSCs存在较大的差异性表达novel microRNA,其靶基因在分子功能、细胞组成、生物过程起着重要作用。这些差异性表达的novel mciroRNAs与靶基因可能是AS发病机制的潜在位点。