大麦GRF家族的基因组鉴定及生物信息学分析

摘要

生长调控因子(grow regulating factor,GRF)是重要的植物转录因子之一,在调控植物生长发育过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学分析,从大麦基因组中鉴定出12个Hv GRF转录因子家族成员,且均具有完整的特征结构域QLQ和WRC。Hv GRF家族成员含有2~5个外显子,蛋白二级结构具有相似的特征,亚细胞定位均位于细胞核。系统进化分析表明,Hv GRF与水稻GRF家族的亲缘关系更为接近。HvGRFs基因启动子区域序列分析表明,植物生长发育、激素信号传导及逆境胁迫响应等相关的顺式作用元件大量存在于HvGRFs启动子序列中。转录组数据表明,Hv GRF基因家族不同成员在萌发的胚、幼苗的根茎、发育的花组织器官、灌浆期的籽粒中存在组织特异性表达模式,推测Hv GRF基因家族成员可能在大麦生长发育中发挥重要的作用。