萧山区宋内氏志贺菌脉冲场凝胶电泳分型分析

摘要

目的对萧山区2010年分离的54株宋内氏志贺菌进行脉冲场凝胶电泳分型(Pulsed-field Gel Electrophoresis,PFGE),分析菌株之间的分子分型特征和遗传相关性。方法 54株宋内氏志贺菌菌株按WS 287-2008标准以生化反应和血清分型进行鉴定分型,并参照美国疾病预防控制中心的PulseNet方法使用脉冲场凝胶电泳进行同源性分型分析,所得结果使用BioNumerics软件进行聚类分析以确定菌株间的亲缘关系。结果 54株宋内氏志贺菌经XbaⅠ酶切分为13个带型,主要带型聚类相似性为92.1%,大部分属于来源高度相似的克隆系。结论建立宋内氏志贺菌PFGE分析方法和初步带型数据库,获得了宋内氏志贺菌的主要克隆系。分离株相似性较高,有可能存在单一感染源,还需要进一步分析比对。