蒺藜苜蓿DUF221基因家族全基因组鉴定及盐响应相关基因筛选

摘要

DUF221蛋白是一类可能与植物响应逆境胁迫相关的功能未知结构域蛋白。为了研究蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)中DUF221基因家族的分布特征和盐胁迫下的表达,本研究对蒺藜苜蓿中具有DUF221结构域的基因进行了全基因组的鉴定和分析。结果表明,蒺藜苜蓿中共鉴定得到13个MtDUF221基因,不均匀的分布在8条染色体上。利用蒺藜苜蓿、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)中的DUF221蛋白进行系统进化分析,将该家族基因分成Clade A、Clade B和Clade C共3个亚家族。编码蛋白基本理化性质、基因结构和保守基序的分析显示了该家族基因进化上具有较强的保守性。进一步利用蒺藜苜蓿基因芯片数据对不同组织部位和盐胁迫下的表达进行分析,筛选到4个转录水平明显受到盐胁迫诱导的基因,2个表达明显被抑制的基因,为今后揭示MtDUF221基因在蒺藜苜蓿响应盐胁迫中的生物学功能提供数据参考。