1株境外输入性新冠病毒奥密克戎BQ.1.1全基因组测序及特征分析

摘要

目的 针对1例境外输入性新冠病毒感染者咽拭子样本开展全基因组测序,掌握输入性新冠病毒基因组特征,为口岸新冠肺炎疫情防控提供科学依据。方法 对1例从江苏口岸入境的输入性新冠病毒感染者的咽拭子样本,用二代测序技术进行全基因组测序,并通过生物信息学软件进行序列分析并构建进化树。结果 获得1株输入性新冠病毒全基因组序列(GenBank No. OP804248),基因组全长29 762 bp,基因分型结果显示为奥密克戎BQ.1.1型。与原始毒株(GenBank No. NC_045512.2)相比,该毒株共有78个碱基发生了突变,59个区域发生了缺失;氨基酸突变有62个,氨基酸缺失14个。结论 奥密克戎BQ.1.1型为江苏口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型,为当地口岸新冠病毒的溯源及防控提供重要科学依据。