一种检测鸡基因组甲基化的新方法:F-MSAP

摘要

以2个品种鸡亲本及其F1代基因组为实验材料,使用荧光标记替代甲基敏感扩增片段多态性(methylationsensitiveamplifiedpolymorphism,MSAP)方法中的同位素标记,优化了实验条件,建立了荧光标记的甲基敏感扩增片段多态性方法(fluorescentlabeledmethylationsensitiveamplifiedpolymorphism,F-MSAP).结果显示,鸡个体基因组的甲基化模式分为3种,甲基化片段约占40%;F1代与亲本比较,F1代甲基化多态模式约有95%来自亲本,变异的甲基化位点约5%,虽然变异的甲基化位点数量少但种类多,共发现14种甲基化程度减弱型,12种甲基化程度增强型.结果表明,F-MSAP是一种有效地检测鸡基因组甲基化的方法,可以用于其他真核生物尤其是基因组复杂、甲基化多态性丰富的高等动植物基因组甲基化研究.