基于网络药理学探索金银花抗菌有效成分及其分子机制

摘要

本文旨在基于网络药理学方法分析金银花抗菌有效成分,预测其分子作用机制。从中药系统药理学数据库与分析平台TCSMP数据库以及文献中收集金银花有效成分及其作用的靶点,通过Uniprot蛋白数据转化为相对应的靶点基因。将有效成分和靶点基因导入Cytoscape3.7.2软件,构建金银花有效成分-靶点网络调控图。通过GeneCards数据库检索并筛选抗菌靶点,与金银花有效成分-靶点取交集得到金银花抗菌核心靶点。将金银花核心靶点基因上传至STRING数据库,构建抗菌靶点蛋白相互作用网络图。最后,通过DAVID数据库将金银花关键靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果显示,在金银花中共获得23种与抗菌活性有关的潜在化合物,获得了137个抗菌靶点。GO富集分析获得条目17个,其中生物过程10个、分子功能1个、细胞组成6个;它们参与了22条相关信号通路。预测槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇和β-胡萝卜素等化合物是金银花抗菌的主要成分。这些化合物作用于MYC原癌基因蛋白(MYC proto-oncogene protein,MYC)、管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等关键靶点,并参与调控TNF信号通路、MAPK信号通路、ErbB信号通路、HIF-1信号通路和Toll样受体信号通路等发挥其抗菌作用。结果表明,金银花具有多成分、多靶点、多通路的抗菌分子机制,为深入阐释金银花及其抗菌分子机制提供理论参考。