春性甘蓝型油菜sBnTCP2基因的克隆及表达分析

摘要

克隆春性甘蓝型油菜相对于蕾期在苗期特异性表达的基因,并对其在各个发育时期以及各组织中的表达模式进行研究。用cDNA-AFLP技术筛选苗期特异性表达的基因片段,根据差异片段设计引物,用RACE技术扩增差异基因两端序列,再根据两端序列设计引物,进行全长cDNA克隆;用RT-qPCR法进行基因表达分析。结果获得了一个昼夜节律基因的CDS全长序列1 077 bp,该基因编码是一个由359个氨基酸残基组成的蛋白,暂命名为sBnTCP2。与油菜基因组序列比对结果显示,sBnTCP2基因位于C1染色体上。生物信息学分析显示,sBnTCP2的编码序列与电子预测的甘蓝型油菜TCP2 (XM_013815648.2)基因的编码序列相似度达99%,其CDS区的第52处、第53处、第54处3个碱基(AAC)缺失。sBnTCP2在油菜不同发育时的各组织中都有表达,但在苗期叶片中表达量最高。sBnTCP2在春性特早熟甘蓝型油菜发育中可能起到重要的调节作用。