粗山羊草响应盐胁迫转录组分析

摘要

利用转录组测序(RNA-Seq)技术对粗山羊草‘AL8/78'在200 mmol/L NaCl人工模拟盐胁迫0h和96h进行了转录组分析。结果表明:盐胁迫处理下上调和下调表达的差异表达基因(DEGs)分别为546个和876个;GO富集分析发现,DEGs主要集中在代谢过程、细胞过程、细胞连接、催化活性等生物过程;KEGG富集分析发现,DEGs主要富集在苯丙酮生物合成、类黄酮生物合成、植物激素信号转导等信号通路。通过对DEGs进行转录因子注释,共注释到41个转录因子,主要包括WRKY、MYB、bHLH、NAC和HSP等类型。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对DEGs进行了表达模式验证,发现其与RNA-Seq测序结果一致,证明了RNA-Seq结果的准确性。本研究为挖掘粗山羊草耐盐基因提供了理论基础。