金黄色葡萄球菌REP-PCR指纹图谱分型方法优化

摘要

目的优化金黄色葡萄球菌细菌基因组重复序列PCR（REP-PCR）指纹图谱分型方法,并在临床分离株分型研究中应用,为构建金黄色葡萄球菌同源性追踪体系提供依据。方法试剂盒法提取金黄色葡萄球菌标准菌株ATCC 25923基因组DNA作为模板,根据参考文献设计REP引物,PCR扩增其基因组中靶序列。优化反应体系Mg2＋浓度、模板量、引物浓度和退火温度,以得到最佳指纹图谱。以优化好的REP-PCR方法对10株金黄色葡萄球菌临床分离株进行分型。结果PCR反应体系Mg2＋浓度2.5 mmol/L,DNA模板量125 ng/25μL,引物REP1R、REP2浓度各0.6μmol/L,退火温度40℃时,指纹图谱条带最清晰、明亮;10株临床分离株指纹图谱均在0.5～1.0 kb之间出现1条相同条带,其中1～3,4,5,8,9号菌株图谱相同;7和10号菌株除在0.5～1.0 kb出现1条条带外,还在1.0～1.5 kb出现1条条带,在1.5～2.0 kb出现1条条带;6号菌株共产生5条条带,分别出现在0.5～1.0 kb（2条）,1.0～1.5 kb（2条）和1.5～2.0 kb（1条）。结论成功建立优化的金黄色葡萄球菌REP-PCR指纹图谱分型方法；10株临床分离株用该法分为3型。