山西太原地区淋球菌NG-MAST基因分型

摘要

目的采用淋球菌多抗原序列分型(NG-MAST)进行淋球菌基因分型,了解山西太原地区淋球菌流行株的菌株基因分型。方法收集山西太原地区淋球菌菌株41例,提取所有菌株的DNA,扩增por和tbpB基因片段,进行测序,在NG-MAST基因数据库里进行比对,用MEGA-X对其进行进化树分析。结果研究41株菌的NG-MAST基因分型,发现新的基因分型共15株(36.59%)。NG-MAST进化图显示NG-MAST3305和NG-MAST2083是山西地区的优势菌株。por1132、por2001、por6993是山西地区por的优势基因型,tbpB4是山西地区的优势基因型。por等位基因号90和5692可能为短链上同一来源基因型;淋球菌的tbpB的进化图可以发现tbpB4、1601、1971、907、75、446的等位基因号亲缘关系比较近,它们可能是短链上来源相同的基因型;淋球菌的NG-MAST的进化图可以发现ST4022和ST New4的亲缘关系比较近,它们可能是短链上来源相同的菌株。结论 NG-MAST可以持续监测山西太原地区淋球菌的基因分型,了解本地区淋球菌流行状况。