基于加权基因共表达网络分析识别卵巢癌的特异性表达基因

摘要

目的探索与卵巢癌分期相关的miRNA,以期寻找卵巢癌的生物学标志物,并用于指导临床治疗。方法首先在NCBI的GEO数据库下载一个卵巢癌的miRNA芯片表达数据。基因共表达网络的构建由R软件的WGCNA包完成。基因的功能注释由基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析完成。结果从1 720个miRNA中共识别出9个模块,其中2个外周血miRNAs模块(棕色和黑色)与卵巢癌分期显著相关,2个枢纽基因AKT3(黑色模块)和DOCK1(棕色模块)与卵巢癌相关。GO分析和KEGG通路分析表明,这2个模块均与IkappaB激酶/NF-κB信号通路有关。结论本文首次运用WGCNA这种高效的系统生物学算法分析与卵巢癌分期相关的miRNA模块及关键的枢纽基因,为未来卵巢癌的研究方向提供新的见解。