SOX4基因表达特征的泛癌分析

摘要

目的通过生物信息学方法探讨并验证SOX4基因在泛癌中的表达特征。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)对SOX4基因进行泛癌分析,从基因表达、生存分析、基因突变、免疫浸润及富集分析等多个方面挖掘SOX4在不同肿瘤致病中的作用。利用定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blotting)验证SOX4在3种常见肿瘤细胞系中的表达情况。结果SOX4在大多数肿瘤中高表达,且与部分肿瘤患者的预后存在明显相关性。在口腔鳞状细胞癌细胞、乳腺癌细胞和人非小细胞肺癌细胞中,SOX4 mRNA和蛋白的水平明显升高。在膀胱尿路上皮癌患者中,SOX4的突变发生率最高。在部分肿瘤中,SOX4的表达与免疫细胞浸润密切相关。SOX4可能通过“病毒致癌”和“肿瘤MicroRNA”通路参与肿瘤的发生。结论SOX4在多种肿瘤的致病中起重要作用,可能是治疗肿瘤的有效靶点。