西太平洋“暖池”区沉积物中的细菌类群及其与环境的关系

摘要

提取西太平洋暖池区海底沉积物柱状样不同层次样品的总DNA, 构建沉积物中的细菌16S rDNA克隆文库, 通过PCR-RFLP分析与序列测定, 对沉积物中的细菌类群及其与环境的关系进行了分析. 结果表明, 该海区沉积物中的细菌分别属于8个主要类群, 其中紫细菌（Proteobacteria）的g-亚群为各个层次中的优势菌群, 而科尔韦尔氏菌属（Colwellia）为优势种属; a-亚群也均有分布; 而b-亚群分布很少. 不同深度之间细菌类群的区别主要在于d-, e-紫细菌亚群和CFB类群（Cytophaga/Flexibacteria/Bacteroides）, 它们在沉积物中的分布均呈现随深度增加而减少的趋势. 系统发育分析表明, 在各个深度沉积物中各有18%~30%的细菌与甲烷代谢相关, 15%~25%的细菌与硫代谢相关, 说明甲烷代谢和硫代谢在该海区的深海物质能量循环中占据着重要地位.