结肠黑变病相关基因金属泛激蛋白-1 cDNA和氨基酸序列分析

摘要

目的 对结肠黑变病相关基因金属泛激蛋白-1 (MPS-1)cDNA序列和氨基酸序列进行综合分析,为其结构和功能的研究奠定理论基础.方法 从Pubmed数据库中获得目标cDNA序列,利用基因和蛋白质分析处理软件DNAMAN、NCBI ORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL等软件对该目标的基因序列和氨基酸序列进行综合分析.结果 MPS-1蛋白cDNA序列长为361 bp,编码84个氨基酸残基,基因序列比对显示该蛋白与核糖体蛋白S27(RPS27)mRNA的编码序列同源度最高,两者核苷酸的相似度为361/361(100％),氨基酸序列比对显示该蛋白与RPS27的氨基酸序列同源度最高,两者氨基酸的相似度为84/84(100％),目标序列中存在1段Ribosomal_S27e家族保守结构域,二级结构和三级结构预测显示目标蛋白中主要存在α-螺旋、B-折叠和无规卷曲的结构.结论 MPS-1蛋白与RPS27同源度高,与肿瘤的发生密切相关.