2019年广州市甲型H1N1流感病毒全基因组序列的遗传特征分析

摘要

目的 对甲型H1N1流感病毒进行基因组全序列遗传特征分析,为流感的科学防控提供新数据.方法 选取7株2019年广州市甲型H1N1流感病毒进行全基因组序列测定,分析其遗传特征.结果 7株病毒的核苷酸同源性最高为PB2基因(98.8％～99.9％),最低为NA基因(97.3％～99.2％).总体上,不同月份的H1N1流感分离株在遗传进化上以时间分布为聚类特征,特别是2019年6月份以后的H1N1分离株与我国使用的2020-2021年疫苗推荐株A/Guangdong-Mao-nan/1536/2019 (H1N1)亲缘关系最近,位于同一进化分支.疫苗株所在分支的分离株除PA和M1蛋白外,其余蛋白均有不同数量的相同特异性氨基酸突变.分离自监测哨点医院流感样病例的毒株与社区流感暴发疫情的毒株属于同一进化分支.全基因组8片段的遗传进化树显示,未发现不同基因来源的基因重配现象.结论 广州市甲型H1N1流感疫情流行株与门诊监测流行株高度同源,进化起源相同.全基因组序列上推荐疫苗株与流行株匹配性较好,未发现基因重配现象.