人直肠腺癌消减杂交差异片段的生物信息学分析

摘要

目的探测人直肠腺癌发生和发展过程中差异表达的基因片段,了解人直肠腺癌的分子生物学机制.方法应用抑制性消减杂交技术, 获得人直肠腺癌差异表达的基因,用生物信息学 cDNA文库筛选的方法,对人直肠腺癌 cDNA消减文库中的差异基因片段的序列作预测和分析.结果用抑制性消减杂交技术随机挑取获得的阳性克隆,提取质粒,双酶切分析,进行序列测定,得到与直肠腺癌发病相关的差异基因片段- 9cDNA( Genbank登录号为 BM360862) ,用 cDNA文库筛选得到一个全长 cDNA序列.基因表达系列分析( SAGE)显示除了直肠腺癌外、 9cDNA还分布于前列腺腺癌、脑干成神经管细胞瘤、胰腺腺癌、胚胎正常血管内皮细胞、脑室管细胞瘤.结论直肠腺癌的发病是多环节和多步骤的过程, 9cDNA与直肠腺癌发病相关,对 9cDNA基因差异片段进一步研究,将为了解直肠腺癌发病的特异相关基因奠定基础.