禽流感分离株GD/1/96(H5N1)非结构蛋白结构建模

郭莹莹; 吴春艳; 王靖飞

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禽流感分离株GD/1/96(H5N1)非结构蛋白结构建模

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为预测H5N1亚型禽流感病毒(AIV)NSI蛋白全长结构,本研究以A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)株NS1蛋白氨基酸序列为目标序列,通过同源建模以及蛋白质结构叠合预测出NS1蛋白全长单体以及二聚体初始结构.采用约束分子动力学方法对初始结构进行优化,并利用立体化学、折叠可靠性、残基包装质量等评判方法对优化后的模型进行评估.结果表明所建立的NS1蛋白全长单体及二聚体结构模型具有很高的可信度,可用于基于结构的功能研究及虚拟筛选等工作.

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来源
《中国预防兽医学报》 |2010年第3期|171-174|共4页
作者
郭莹莹; 吴春艳; 王靖飞;
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作者单位

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江,哈尔滨150001;

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江,哈尔滨150001;

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江,哈尔滨150001;

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正文语种 chi
中图分类家畜病毒学;
关键词
禽流感病毒; H5N1; NS1; 同源建模;

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