杭州市急性呼吸道感染婴幼儿中副流感病毒3型遗传进化及其感染特征研究

摘要

目的分析杭州市婴幼儿中副流感病毒3型（HPIV-3）的遗传进化及其感染与合并感染情况。方法收集2009年12月至2013年3月杭州地区医院0~11岁婴幼儿急性呼吸道感染病例咽拭子或呼吸道吸出物样本,共856份（男性553例,女性303例）。采用逆转录荧光定量PCR（qRT-PCR）法检测HPIV-3,阳性样本用特异性引物扩增HN基因进行基因测序,将测序所得序列用Clustal X 2.0软件进行比对,然后使用MEGA 6.0软件,采用邻接法建立系统进化树。同时,用qRT-PCR法检测与其他呼吸道病原体的合并感染情况。采用χ~2检验比较不同特征患儿单一感染与合并感染情况。结果856例患儿中,HPIV-3阳性84例（9.6%）。男性患儿HPIV-3感染阳性率为10.0%（55/553）,女性患儿阳性率为9.6%（29/303）（χ~2=0.03,P=0.860）。84例HPIV-3阳性病例的合并感染率为49%（41例）,其中与鼻病毒合并感染检出率较高,为41%（17例）;1岁以下患儿的合并感染率为54%（36/67）,高于单一感染率[46%（31/67）]（χ~2=4.78,P=0.029）;单一感染患儿伴有肺炎症状占93%（37/40）,高于合并感染组[76%（29/38）]（χ~2=3.92,P=0.048）。同源性分析结果显示,56例患儿HPIV-3的HN基因编码区核苷酸和氨基酸序列一致性均较高,一致性分别为96.9%~100.0%和98.6%~100%。基于HN基因的进化树分析表明,杭州株均归属于C3亚群。结论杭州市婴幼儿的急性呼吸道感染与HPIV-3有关;HPIV-3 HN基因型变异较小,但进化具有一定地域特征;与其他呼吸道病毒的合并感染率较高。