我国汉族Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原-DQB1基因启动子区单核苷酸多态性的研究

摘要

目的探讨我国汉族 Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原（HLA）-DQB1基因启动子区单核苷酸多态性（SNP）。方法采用病例-对照研究方法。应用聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）-克隆-测序方法检测88例汉族 Vogt-小柳原田综合征患者和88例非 Vogt-小柳原田综合征正常对照者的 HLA-DQB1基因启动子区（QBP）等位基因。使用 Chromas 软件和 Bioedit 软件进行序列比对和分析测序结果。应用卡方检验或 Fisher 精确概率法分别对受试者 PCR-SSCP 带型、基因频率进行统计分析。结果受试者（患者与正常人）HLA-DQB1基因启动子区（QBP）分为16种聚丙烯酰胺凝胶电泳带型,带型 QBPb（对应序列为QBP2.1+77C＞A,X~2=26.01,Pc＜0.001）和QBP1（对应序列为 QBP3.3,X~2=16.99,Pc＜0.001）在 Vogt-小柳原田综合征患者中出现频率显著高于正常人。而 QBPg（对应序列为QBP3.1,X~1=12.10,Pc＜0.05）和 QBPn（对应序列为 QBP6.1+39G＞A,X~2=14.64,Pc＜0.05）在 Vogt-小柳原田综合征患者中出现频率显著低于正常人。受试者启动子区共存在12种单核苷酸多态性,其中 Vogt-小柳原田综合征患者的-189C/A 的 C 等位基因频率显著高于正常人（X~2=45.92,P=0.000）,而-227G/A 的G等位基因频率低于正常人（X~2=15.63,P=0.000）。结论 HLA-DQB1启动子区-189C/A的 C 等位基因可能是 Vogt-小柳原田综合征遗传易感因素,而227G/A的G等位基因可能是 Vogt-小柳原田综合征的遗传保护因素。（中华眼科杂志,2008,44:870-875）