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泛癌整合分析miR-200家族靶标肿瘤基因异质性的研究

         

摘要

cqvip:目的探讨miR-200家族对不同肿瘤预后的影响及其靶标基因调控异质性的机制。方法从癌症基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)下载泛癌研究项目(PanCanAtlas)中21种不同组织病理学恶性实体瘤样本的转录组数据和临床表型,并分析miR-200家族与肿瘤预后的关系。进一步选择生存风险评估结果互相矛盾的5种肿瘤进行miR-200家族靶标基因的WGCNA聚类分析。收集膀胱癌组织标本,采用免疫组织化学法和荧光定量PCR验证肿瘤组织中与miR-200家族表达显著相关的靶标基因的表达,并分析其对患者生存的影响。结果miR-200家族高表达是膀胱癌和胃腺癌预后的保护因素(HR=0.55~0.68,P=0.0001~0.0340;HR=0.61~0.72,P=0.0055~0.0170),是肝细胞癌和胸腺瘤预后的不利因素(HR=1.46~1.65,P=0.0061~0.0120;HR=7.44~13.04,P=0.0002~0.0210);miR-141和miR-429对肾乳头状细胞癌生存的影响相反。基因聚类分析显示,miR-200家族靶标TIMP2基因表达可延长膀胱癌患者生存时间,miR-141负调控肾乳头状细胞癌EPHA2基因而延长患者生存时间。膀胱癌组织的TIMP2蛋白与miR-200家族表达呈负相关,miR-200家族高表达患者预后较好。结论miR-200家族对不同肿瘤预后的影响存在异质性,可能是miR-200家族靶标分子在不同肿瘤的表达存在差异,导致miR-200家族调控生物学功能的异质性。

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