柯萨奇B组3型病毒中国分离株VP4、3D基因序列及系统发生树分析

摘要

目的研究柯萨奇B组3型病毒(CVB3)中国分离株结构蛋白VP4、非结构蛋白3D基因序列及变异性.方法在HeLa细胞中增殖病毒,用RT-PCR扩增目的基因片段,与pMD18-T载体连接,PCR初步鉴定后测序,进行序列同源性及系统发生分析.结果 CVB3中国分离株VP4基因含207个碱基,编码69个氨基酸,与Nancy株氨基酸同源性为97.10%;3D基因含1386个碱基,编码462个氨基酸,与Nancy株氨基酸同源性为97.62%.在系统发生中,CVB3中国株VP4基因、3D基因均与Nancy株聚簇.结论 CVB3中国分离株VP4和3D基因长度与Nancy株一致,进化上属同一分支.