动物源性和人源性甲型流感病毒（H1N1）血凝素（HA）的特征分析

摘要

目的研究动物源性和人源性甲型H1N1流感病毒（influenza A virus）血凝素（hemagglutinin,HA）的特征,以探讨动物源性和人源性甲型H1N1流感病毒血凝素之间的关系。方法从美国生物信息中心（NCBI）下载禽（鸟）源、猪源、人源的甲型H1N1流感病毒血凝素氨基酸序列,使用Clustal W2.0生物学软件比较上述血凝素氨基酸序列,并建立甲型H1N1流感病毒血凝素氨基酸序列的进化树。结果 2009年分离的人源性甲型流感病毒血凝素氨基酸序列同源性非常高,达到了99%～100%,而2009年分离的人源性甲型流感病毒血凝素氨基酸序列和禽（鸟）源,猪源的甲型流感病毒血凝素氨基酸序列之间的同源性非常低,只有77%～90%（只有猪源ABW36355和2009年分离的人源甲型流感病毒血凝素氨基酸序列同源性为90%,余同源性为77%～83%）;蛋白生物进化树表明禽源（鸟）、猪源、人源的甲型流感病毒血凝素氨基酸序列明显分为3个大的分支。2009年分离的人源性甲型流感病毒血凝素氨基酸序列（ADA71154除外）与疫情前分离得到的人源的血凝素氨基酸序列同源性很低（79%～80%）,并且进化树分为3个分支。结论 2009年流行的甲型H1N1流感病毒是一种新的流感病毒,病毒的血凝素氨基酸序列之间的同源性非常高,而和猪、禽（鸟）源的甲型H1N1流感病毒的血凝素氨基酸序列之间的同源性非常低,从这一层面上来讲,目前流行的甲型流感病毒的血凝素的基因并不是猪源和禽源,和疫情前人源的血凝素比对的结果也表明,2009年流行的甲型H1N1流感病毒也并不是直接源于2009年以前的人源流感H1N1病毒,而应该是另有来源。