RTKN2、LDLR、APOB和APOC1基因多态性与类风湿性关节炎的相关性

摘要

目的:建立RTKN2基因rs3125734 C＞T、LDLR基因rs688 C＞T、APOB基因rs693 C＞T和APOC1基因rs4420638 A＞G四个SNP位点的PCR-HRM分子诊断方法,并研究其与兰州地区汉族人群类风湿关节炎易感的相关性.方法:通过设计引物和PCR-HRM检测体系优化,建立四个SNP位点的基因分型方法.检测588例RA患者和200例健康对照者标本,通过病例对照研究分析其RA易感性.结果:经测序验证所建PCR-HRM检测方法的正确性.结果显示,rs3125734和rs688位点的基因型和等位基因频率在RA组和对照组间存在统计学差异(P分别为0.046和0.016、0.014和0.02),rs3125734杂合突变型CT在RA组与对照组间差异有统计学意义(x2=4.013,P=0.045,OR=1.613,95％ CI:1.010-2.576),rs688纯合突变型TT在两组间有显著差异(x2=6.853,P=0.009,OR=0.273,95％ CI:0.103-0.721).rs693和rs4420638位点基因型和等位基因频率在RA组和对照组间差异无统计学意义(P＞0.05).经RF和anti-CCP将RA组分层后,rs4420638位点基因型和等位基因频率在RF(-)RA组与对照组间有统计学差异(x2=4.710,P=O.030;x2 =4.110,P=0.043),其杂合突变型AG在两组间存在显著差异(x2=4.046,P=0.044,OR=1.799,95％ CI:1.015-3.186);rs693在各组间无显著差异(P＞0.05).构建rs688和rs4420638单倍型,单倍型CA和TA在RA组和对照组间有显著差异(P=0.020,OR=1.408,95％ CI:1.054-1.881;P=5.73×10-5,OR=0.443,95％ CI:0.295-0.664).结论:建立的rs3125734、rs688、rs693和rs4420638位点PCR-HRM分子诊断方法可用于常规化检测.rs3125734、rs688和rs4420638位点是兰州地区汉族人群的RA易感基因,rs3125734位点CT基因型和rs4420638位点AG基因型是RA发病的危险因素,而rs688位点TT基因型是RA的保护性因素.rs688和rs4420638的单倍型CA可显著增加RA的发病风险,TA可降低RA的发病风险.