2017年吉林省水痘-带状疱疹病毒分子特征分析

摘要

目的 分析2017年吉林省水痘-带状疱疹病毒（varicella zoster virus,VZV）基因型别,区分疫苗株与野毒株。方法 2017年1～3月在吉林省收集到的10份疑似水痘患者的疱疹液或咽拭子样本,采用实时荧光定量PCR方法检测病毒核酸,用普通PCR扩增病毒的ORF22、ORF38和ORF62的特定区域。用ORF22的5个SNPs确定病毒株的基因型别,用ORF38和ORF62的4个SNPs区分疫苗株与野毒株。使用MEGA5和BioEdit软件分析序列结果。结果 10份疑似样本均为VZV阳性,Clade 2遗传支。其中JL17-7样本在38 048位发生了C→T的同义突变。ORF22核苷酸的亲缘性关系树分析发现,10份样本均和Clade 2代表株在同一个分支上,与Clade 2代表株的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.5%～100%和99.3%～100%。10份样本的ORF38和ORF62的4个特异SNPs均为A-T-T-T,与野毒株一致。结论 2017年吉林省流行的VZV均属Clade 2遗传支,且均为野毒株。