马蓝与路边青的matK序列差异与分子鉴定方法分析

摘要

目的：研究拟基于mat K序列分析,探讨马蓝与路边青相互鉴别的新方法。方法：从Gen Bank核酸数据库下载马蓝与路边青mat K序列,应用Clustal X 2.1软件进行SNP鉴别位点分析,应用MEGA5.0软件计算种内和种间的（K2P）遗传距离,并构建邻接（NJ）系统聚类树。结果：获得8个马蓝mat K序列及12个路边青mat K序列,分析显示马蓝与路边青的mat K序列具有近百个SNP位点,且其中多是马蓝与路边青特有的,可作为二者间相互鉴别的分子标记。且马蓝的最大种内K2P遗传距离0.001与路边青最大种内K2P遗传距离0.005均远远小于马蓝与路边青的种间K2P遗传距离0.144-0.149,构建的系统发育树显示马蓝与路边青单独聚为一类。结论：mat K序列可为马蓝与路边青的相互鉴别提供新的分子鉴定方法。