深圳地区1992-2008年HIV-1分子流行病学研究

摘要

目的了解1992-2008年深圳地区HIV-1亚型的流行特点。方法抽取1992-2008年深圳地区HIV确认阳性患者血清489份,应用巢式PCR扩增膜蛋白基因（env基因）,并对PCR产物进行序列测定和分析。结果共有464份样本获得分型结果,主要为CRF01 AE亚型（64.4%,299/464）,其次是CRF BC（17.5%,81/464）、B’（14.7%,68/464）和B亚型（2.4%,11/464）,还发现C（0.4%,2/464）、Al（0.2%,1/464）、CRF02 AG（0.2%,1/464）和CRF06 cpx（0.2%,1/464）亚型/重组亚型。CRF01 AE和CRF BC主要流行于异性性传播、同性性传播和静脉吸毒人群,B’亚型主要经异性、同性性传播和血液传播。另外经系统进化分析发现,不同时间段的样本出现明显的时间汇聚现象,并伴随传播途径的聚集以及交叉感染现象;各亚型/重组株样本组内及与标准参考株间的基因离散率随着时间的增加有明显增大趋势。结论 CRF01 AE重组株是深圳地区HIV-1的主要流行株,CRF BC、B、B、C、A1和CRF02AG、CRF06cpx亚型/重组亚型也在深圳地区少量流行,各亚型在流行过程中发生较大变异。