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核桃JrGI基因克隆及表达分析

     

摘要

GI(GIGANTEA)基因是生物节律钟关键输出基因,克隆核桃JrGI基因,并分析其在不同组织及不同时间的雌花芽表达情况,旨在为研究核桃JrGI基因的功能奠定基础。采用RT-PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction)技术从‘新新2号’叶片中克隆获得JrGI基因全长序列,对其进行生物信息学分析、烟草亚细胞定位及表达分析。结果表明,JrGI基因全长为3 516 bp,编码1171个氨基酸,分子量为128.60 kDa,等电点(isoelectric point)为6.13,属于亲水性蛋白;系统进化分析表明JrGI蛋白与胡杨GI蛋白亲缘关系最近。烟草亚细胞定位显示JrGI蛋白位于细胞核中。对‘新新2号’雌花芽不同时间段JrGI、JrCO和JrFT基因进行RT-qPCR(real-time quantitative PCR)分析,结果表明在形态分化临界期的雌花芽中表达量最高,推测JrGI在此时间对雌花芽的分化起到重要作用。另外,JrGI基因在‘新新2号’各组织中均有表达,且在叶片中表达量最高,推测JrGI基因在核桃叶片发育过程中也发挥重要功能。

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