基于主成分分析和因子分析估计新疆褐牛体型性状的遗传参数

摘要

旨在估计新疆褐牛体型性状的遗传参数,同时应用主成分分析和因子分析进行降维后探索各主成分和因子之间的遗传规律,为育种方案制定提供参考。本研究采用SAS软件进行主成分和因子分析,利用BLUPF90软件采用平均信息约束最大似然法配合动物模型对9个新疆褐牛核心育种场的1016头新疆褐牛泌乳牛的27个体型性状及主成分和因子得分表型进行遗传参数估计。研究结果表明,除蹄踵深度、蹄角度和乳房平衡性外,其它体型性状均属于中高遗传力性状。主成分(1~8;特征值≥1)和潜在因子(1~8;特征值≥1)都能够解释总方差的57%,各主成分和因子能够综合反映牛只体躯结构、肌肉度、尻部、肢蹄和泌乳系统的信息,各主成分和各因子的遗传力估计值范围分别为0.13(PC6)~0.46(PC1)和0.08(F3)~0.48(F1),基于主成分分析估计遗传相关的范围为-0.76(PC3-PC6)~0.74(PC3-PC4),因子分析估计遗传相关的范围为-0.75(F3-F6)~0.86(F1-F6)。结果提示,新疆褐牛体型性状中除蹄踵深度、蹄角度和乳房平衡性外,其它性状均属于中高遗传力性状,在体型性状的评估中可以考虑使用主成分和潜在因子,将多维度的体型性状简化为新的变量,这种方法可以避免分析大量相关性较高的性状,从而降低分析大量数据而造成的计算负担。