不同尾型绵羊群体尾脂差异lncRNA的表达验证与功能预测

摘要

lncRNA(长链非编码RNA)在许多重要的生物学过程中起关键作用,可调控绵羊脂肪沉积.本研究选择新疆2个不同尾型的绵羊群体巴什拜羊(肥尾型)、巴什拜羊与野生盘羊的杂交群体(小尾型),分别取其尾部组织进行全转录组测序,筛选差异表达的2个lncRNA(编号分别是MSTRG.37980、MSTRG.38164)进行表达验证,并且与其靶基因(SCD、GPAM)进行联合分析,预测其潜在功能.qRT-PCR检测了2种绵羊群体11个部位的表达情况,结果表明,2个lncRNA的表达与RNA-Seq结果一致;SCD基因和MSTRG.37980在巴什拜羊和杂交二代羊各组织部位表达规律呈相同趋势,SCD基因和MSTRG.37980在巴什拜羊尾脂中的表达极显著高于杂交二代羊;GPAM基因和MSTRG.38164在巴什拜羊和杂交二代羊各部位的表达规律呈相同趋势,均为巴什拜羊肝脏中表达量显著高于二代羊.结果揭示:MSTRG.37980可能通过正向调控作用,增加绵羊尾部SCD基因的mRNA表达,导致大尾型绵羊尾脂沉积极显著高于小尾型;MSTRG.38164可能通过对其靶基因GPAM调节肝脏内脂肪代谢,间接实现调节大尾型绵羊的尾部脂肪沉积.