延黄牛ELOVL6基因cDNA序列克隆及其在各组织间的表达差异

摘要

为研究超长链脂肪酸延伸酶6 (ELOVL6)基因功能,本实验以延黄牛肝组织总RNA为模板,根据GenBank公布的基因序列设计引物,应用RT-PCR技术扩增ELO VL6基因,将扩增产物构建到PMD18-T载体进行测序,获得延黄牛ELO VL6完整CDS序列,应用生物信息学软件分析序列及其蛋白结构.以延黄牛心、肝、肺、肾、胃、十二指肠、皮下脂肪和背最长肌总RNA为模板,通过实时定量荧光PCR技术,检测ELOVL6基因在延黄牛各个组织间的表达差异.结果表明:延黄牛ELOVL6基因共编码264个氨基酸,预测其分子量为31.282 ku,理论等电点为9.46,为疏水性蛋白,无典型的信息肽切割位点,含有18个氨基酸磷酸化位点(分值＞0.5),在延黄牛皮下脂肪组织中的表达量显著高于其他组织(P＜0.05).本研究首次成功克隆获得延黄牛ELOVL6基因CDS完整序列,对其结构、蛋白理化特性以及该基因在延黄牛各组织间的表达差异进行详细分析研究,为开展延黄牛ELOVL6基因的功能及肉质基因筛选的工作提供理论基础和科学依据.